中央空調停運后，冷卻水系統和冷凍水系統的清洗可用采取單臺設備清洗方式或全系統清洗方式。但無論是單臺設備清洗還是全系統清洗，一般都使用清洗槽和清洗泵將單臺設務或原系統(可使用原系統的水泵)構成一個閉合回路進行循環清洗。
清洗一般按下列程序進行。滅藻清洗、堿洗、封存、(中)鈍化、堿洗后水沖洗、運行、(中和)預膜、酸洗、漂洗、酸洗后水沖洗、水沖洗(檢漏)
中央空調因其強大的功能而日益流行，同時具有冷暖空調功能的同時，還能調節空氣。目前選擇中央空調的家庭已經有很多，但由于對中央空調不熟悉，很多人還沒有注意到它的清洗和保養。中央空調長時間運行，管道、過濾器、換熱面表面集聚污物可能會造成"帶病工作"，使系統換熱效率降低，通風阻力增大，降低空調工作質量，增加不必要能耗，大大提高系統運營成本。
冷水機組的開、停機順序：
要保證空調主機啟動后能正常運行，必須保證：
冷凝器散熱良好，否則會因冷凝溫度及對應的冷凝壓力過高，使冷水機組高壓保護器件動作而停車，甚至導致故障。
蒸發器中冷水應循環流動，否則會因冷水溫度偏低，導致冷水溫度保護器件動作而停車，或因蒸發溫度及對應的蒸發壓力過低，是冷水機組的低壓保護器件動作而停車，甚至導致蒸發器中冷水結冰而損壞設備。
一般的中央空調只有在一個時節應用，十分不便捷。而中型中央空調不但能夠在一年四季應用，可以在秋春兩個季節應用，使用率更高，十分環保節能。另外，家用中央空調采用與眾不同的設計方案，送風量大，外的數量少，因此噪聲大自然也就不大，運輸出去的風環境濕度較小，每一屋子的溫度都十分勻稱，確保身體的舒適感。此外，家用中央空調能夠應用集中供暖的開水來集中供暖，還可以安裝掛壁式地天然氣熱水器做為電力能源來集中供暖，不容易受限制，房主能夠無拘無束配搭。終，家用中央空調的運行十分靠譜，返修率很低，維護保養和檢修起來都十分便捷，使用期將近50年時間。
