北京兒童醫院精神科主要服務對象為18歲以下的兒童和青少年，包括精神疾病診室、心理室、心理訪談室、心理測量室、物理室、沙盤室、生物反饋室、壓力與情緒管理室、行為觀察室、科學研究室等。
北京兒童醫院精神科診療范圍(按專業擅長以詞條形式而列)：注意缺陷多動障礙、多動癥、孤獨癥譜系障礙、自閉癥、抽動癥、抽動穢語綜合征、學習困難、學習障礙、厭學、智力低下、言語和語言發育障礙、緘默癥、言語發育延遲、口吃、情緒和行為障礙、焦慮障礙、分離焦慮、強迫癥、恐怖癥、學校恐怖癥、疑病癥、軀體形式障礙、癔癥、心境障礙(躁狂和抑郁障礙)、心身疾病、品行障礙、網絡成癮行為、精神濫用、應激障礙、睡眠障礙、進食障礙、厭食癥、精神殘疾(孤獨癥)評估、腦部疾病或軀體疾病所致的或共患的精神障礙聯絡會診等。
北京兒童醫院積極發揮學科龍 頭作用，領航兒科行業發展。2013年牽頭組建北京兒童醫院集團，創新“病人不動、醫生移動”的模式服務全國患兒，目前理事單位成員已達57家。醫院與美國、俄羅斯、加拿大、意大利、澳大利亞、瑞典、德國、法國、日本、新加坡等國家的兒童醫療機構和科研院所建立了良好的關系和廣泛的合作，是科技部認定的兒童重大疾病國際科技合作基地。
在國內率先開展了兒童正常腦發育和神經障礙性疾病的多模態磁共振研究,首次利用酰胺質子轉移成像和磁化轉移成像技術發現兒童腦白質的游離蛋白含量隨著腦發育進程逐漸減低,提出APT成像技術可以用來監測兒童的髓鞘化形成過程。2012年1月提出腦認知功能癱瘓概念(認知癱, Cognitive palsy, CP)，是繼Kanner之后對腦認知的重大推進。這是一個全新的精神病理學概念。目前正利用彌散張量磁共振成像技術建立0-2歲嬰幼兒腦白質模板,以填充和彌補人類腦計劃中嬰幼兒腦發育的空白?
