關稅保函（Guarantee for the Customs Duties）是指擔保銀行應進口商（含加工貿易企業）的申請而向海關出具的、保證進口商履行繳納關稅義務的書面文件。關稅保函主要包括兩種類型，即關稅保付保函、加工貿易稅款保付保函。
保函的有效期通常從開立之日起到工程合同預計竣工日期延長3個月為止。如果工程未按時完工，申請人在保函到期前需要辦理延期手續。當工程項目出現拖欠農民工工資的情況時，由人社部門和行業主管部門共同出具書面通知，啟動保函賠付程序。金融機構需要在收到通知后的3個工作日內劃撥資金至指定的賬戶，用于支付拖欠的工資。
商業保函指的是，除了銀行以外，由其他商業機構出具的保函，一般出具保函的公司都是專業的擔保機構或商業機構的信用擔保。商業保函也是包括了很多種的，比如預付款保、農民工工資支付保函、質量保函、投標保函、履約保函等，這些都是屬于商業保函。
預付款保函（advance payment guarantee）承包人要求銀行向業主(發包人) 出具的保證業主所支付的工程預付款用于實施項目的一種信用函件。擔保銀行應為業主所接受。如承包人不履約，業主可憑保函向擔保銀行索賠。