商業保函指的是，除了銀行以外，由其他商業機構出具的保函，一般出具保函的公司都是專業的擔保機構或商業機構的信用擔保。商業保函也是包括了很多種的，比如預付款保、農民工工資支付保函、質量保函、投標保函、履約保函等，這些都是屬于商業保函。
預付款保函（advance payment guarantee）承包人要求銀行向業主(發包人) 出具的保證業主所支付的工程預付款用于實施項目的一種信用函件。擔保銀行應為業主所接受。如承包人不履約，業主可憑保函向擔保銀行索賠。
如果約定了雙倍返還或具有定金獨特屬性的內容，符合定金法則，則是定金；如果沒有出現"定金"字樣，也沒有明確約定適用定金性質的處罰之類的約定，已經交納的履約保證金，就不是定金，而是其他金錢質。約定了履約保證金卻又沒有交納的，關于履約保證金的約定成立但不發生法律效力（因為，質押合同也是實踐性合同，必須以交付為生效條件）。
適用于所有公開招標、議標時，業主要求投標人繳納投標保證金的情況。 招標人為避免投標人在評標過程中改標、撤標，或中標后拒簽合同而給自身造成損失，通常都要求投標人繳納投標保證金，以制約對方行為。投標保函是現金保證金的一種良好的替代形式。