脈沖袋式除塵器結構主要由上部箱體、中部箱體、下部箱體（灰斗）、清灰系統和排灰機構等部分組成。脈沖袋式除塵器性能的好壞，除了正確選擇濾袋材料外，清灰系統對脈沖袋式除塵器起著決定性的作用。為此，清灰方法是區分脈沖袋式除塵器的特性之一，也是脈沖袋式除塵器運行中重要的一環。
其工作原理將壓縮空氣在極短暫的時間內高速噴向除塵濾袋，同時誘導數倍于噴射氣量的空氣形成空氣波，使濾袋由袋口至底部產生急劇的膨脹和沖擊振動，在短促的時間內形成濾袋往復地“鼓、癟、鼓”的波浪形變形，使粉塵層發生變形、斷裂，以塊團狀脫離濾布并受重力作用下落。清灰時，清灰氣流在使濾袋膨脹變形的同時也穿過袋壁和粉塵層。
含塵氣體由除塵器進風口進入中、下箱體，含塵氣體通過濾袋進入上箱體過程中由于濾袋的各種效應作用將塵氣分離開，粉塵被吸附在濾袋上，而氣體穿過濾袋經文氏管進入上箱體，從出風口排出。含塵氣體通過濾袋的凈化過程、隨著時間的增加而積附在濾袋上的粉塵越來越多，増加了濾袋的阻力，致使通過濾袋氣體量逐漸減少。為使阻力控制在限定范圍內（一般為120～150毫米水柱），保證所需氣體量通過由控制儀發出指令，按順序觸發各控制閥開啟脈沖閥，氣包內的壓縮空氣瞬時地經脈沖閥至噴吹管的各孔噴出，在經文氏管噴射到各對應的濾袋內。濾袋在氣流瞬間反向作用下急劇膨脹，使積附在濾袋表面的粉塵脫落，濾袋得到再生。被清除掉的灰塵落入灰斗，經排料閥排出機體。積附在濾袋上的粉塵被有周期地脈沖噴吹清除，使凈化的氣體正常通過，保證除塵系統運行。