1、分工合理，職責明確很多企業的領導在實施MES時有一個誤區，他們認為：“計算機能夠解決一切的管理問題” 。事實上，許多企業面臨的管理問題是不可能單單靠計算機就能解決的，必須要靠企業自身科學的組織、嚴格的規章以及有效的控制進行解決。計算機只能通過信息的獲取與加工、一定的流程的控制來支持企業的管理思想的貫徹。
有些企業的組織結構方面不合理、職能相互重疊，其結果往往是責任不清、相互的扯皮。這一方面妨礙了MES系統的順利實施，另一方面也很難保證MES系統正常的地運行。因此，在MES系統實施時，必須對企業的業務流程進行合理的重組，去除重疊的部門的責能，減少無效的勞動，合理的分工、明確責職。這樣既可以簡化MES軟件的權限的設置和流程的控制，又可以保證了信息處理的及時性，為MES系統的實施提供組織保證。
2、定置的改善車間的環境
定置，是指通過對生產和工作的環境的分析，把生產以及工作需要的物品按照工藝的需要科學地確定位置。定置管理，則是指對現場的物品定置的設計、組織、實施、控制，使現場的管理達到科學化、規范化、經?；娜^程。定置的管理為生產者在較短的時間內用較低的成本制造出高質量的產品提供良好的客觀的條件。通過定置的管理，理順物流，可以為MES系統的實施提供良好的車間的環境。
3、MES系統項目的正確實施
完善了管理環節，接下來就是要考慮MES系統項目的實施。一個典型的MES系統實施的進程，主要包括前期的工作、實施的準備、模擬的運行與試運行、切換運行以及新系統的運行幾個階段。再就是項目的前期，打好基礎。
4、人員方面得以保證
MES系統實施，通常會涉及到計算機的人員、企業的管理人員、車間現場的操作人員和具體的業務人員等方面。不僅涉及的面廣，而且各類人員的文化水平、業務的能力、計算機的應用水平也是參差不齊。因此，為了保證MES系統的順利的實施，必須對相關的人員進行足夠的培訓。
對不同類型、不同層次人員的培訓的方式應有所不同。實際上，在整個MES系統實施的過程中，培訓工作是貫徹始終的。不僅要在實施準備的階段進行原理的培訓，而且在實施準備、模擬的運行以及試運行、切換運行、新系統的運行過程中也要進行有關的培訓，如軟硬件產品的培訓、系統管理員的培訓和持續擴大的培訓等。只有企業的員工對MES系統軟硬件的產品有了一定的了解，才能夠保證系統終的順利的實施和應用。
我們一再強調，MES系統只是一套工具，能否把它應用得恰到好處，還是需要企業自身下很大功夫的！