把保函與跟單信用證相比，當事人的權利和義務基本相同，所不同的是跟單信用證要求受益人提交的單據是包括運輸單據在內的商業單據，而保函要求的單據實際上是受益人出具的關于委托人違約的聲明或證明。這一區別，使兩者適用范圍有了很大的不同，保函可適用于各種經濟交易中，為契約的一方向另一方提供擔保。另外，如果委托人沒有違約，保函的擔保人就不必為承擔賠償責任而付款。而信用證的開證行則必須先行付款。
銀行僅負有對保函規定的單證在表面上進行謹慎審查的義務。根據國際商會1992年公布的《見索即付保函統一規則》和聯合國1995年簽訂的《聯合國獨立性保函與備用信用證公約》規定，保證人雖不對受益人所提交的單證的正確性承擔責任，但保證人首先應盡合理的謹慎，對單證在表面上是否適當進行審查，如單證是否齊全，只要所提交的單證經合理謹慎、審查符合保函規定的表面要求，保證人就應付款，即便單證的內容是虛假的，形式是偽造的。
銀行對受益人的賠償請求負有通知義務。在受益人正式提出索賠時，保證人應立即通知委托人，并將受益人所提交的單證悉數傳遞給委托人，以便委托人根據基礎合同的具體履行情況對受益人的索償提出抗辯。如果保證人怠于通知并因此給委托人造成損失，保證人應自行承擔這部分損失，無權向委托人要求補償。此外，除非保證人能十分確定地證明受益人的索償具有欺詐性，即受益人明知委托人沒有違約而惡意提出索償，否則保證人對受益人索償的任何拖延都構成對見索即付銀行保函的違約。
根據委托書和反擔保形成的追償權。首先，委托人向擔保行出具的委托書中應明確記載二項重要內容：一是委托擔保行出具見索即付銀行保函，二是承諾一旦擔保人依據保函承擔付款責任，委托人應無條件立即予以補償。
其次，擔保行還可以要求委托人以其財產或由第三人提供反擔保。根據委托書和反擔保函，擔保人在承擔擔保責任后即可對委托人行使追償權。若以財產為反擔保物，則可以從該擔保物的變賣價款中優先受償。若由第三人提供保證，則可向反擔保人追償。