同仁醫院現有中國工程院院士1名，北京學者3名，長江學者1名，享受政府特殊津貼專家11名，獲、北京市突出貢獻專家12名。作為首都醫科大學第四臨床醫學院，醫院承擔著重要的教學任務。醫院現有學位點28個，其中博士學位點13個。碩士生導師114人，博士生導師41人。擁有15個北京市住院醫師培訓基地。
改革開放以來，醫院共獲得省部級以上科技成果獎勵138項，其中8項，獲得國家自然科學基金資助項目253項。
在臨床相關研究方面，眼底專科開展了增生性玻璃體視網膜病變發病機制的研究，視網膜下人工假體植入技術及組織相容性研究，高度近視眼致病基因定位及蛋白質組學分析，黃斑營養不良的致病基因定位研究，年齡相關性黃斑變性發病危險因素和早期干預研究，以及眼病的流行病學研究等。持續不斷的獲得了多項及省部級課題經費的支持。發表了系列高質量研究論文，形成了同仁品牌效應和國際影響力。北京同仁醫院眼底專科堅持以臨床服務為根本，以科研創新為導向，醫療、教學、科研、預防發展的目標，推動了創新型的科學研究工作的持續開展和學科臨床服務水平的不斷提高。
青光眼科的臨床診療技術長期居于國內水平，接近國際水平，這是我們多年來的特色，也是在學術界常年保持水平的重要基礎。以惡性青光眼的診斷和為代表，在難治性青光眼的診斷和方面，始終處于國內水平，這方面的研究成果先后獲得北京市科技進步二等獎和三等獎;在許多青光眼診斷技術的應用方面，青光眼科都走在國內同行的前列，比如應用二極管激光睫狀體光凝技術各種難治性青光眼，應用激光小粱成型術早期開角型青光眼和殘余性青光眼，青光眼白內障的聯合手術，非穿通小粱切除手術，引流植入物手術、粘小管成型術、小梁消融術、全周小梁切開術先天性青光眼等。
在科研方面，近年來，在原發性閉角型青光眼和原發性開角型青光眼發病機制和早期診斷方面做出重大成績，其科研成果連續獲得2013年和2014年國家科技進步二等獎兩項，2012年中華醫學獎一等獎一項，北京科技進步二等獎一項。同時多人多項目承擔國家和北京市重點科研項目。
