醫院擁有5位中國工程院院士，1百多名技術三級以上專家，1千多名高職專業技術人員。醫院先后獲得省部級以上科技成果獎勵1300余項，其中，國家科技進步一等獎7項，二等獎20項，國家發明獎2項，軍隊科技進步一等獎21項。 [2]
2017年11月11日下午，復旦大學醫院管理研究所正式發布了《2016年度中國醫院排行榜》和《2016年度中國醫院專科聲譽排行榜》，中國人民解放軍總醫院名列第三。
中國人民解放軍總醫院前身是中國協和醫學院第二臨床學院，1953年10月，總后方勤務部衛生部決定將“中國協和醫學院第二臨床學院”改為“軍委直屬機關醫院”。
1954年7月，總后方勤務部衛生部將“軍委直屬機關醫院”改為“中國人民解放軍第三〇一醫院”。
1957年6月，國防部批示“中國人民解放軍第三〇一醫院”番號撤銷，改稱為“中國人民解放軍總醫院”。
軍醫進修學院是以解放軍總醫院為依托建設和發展起來的，始建于1958年11月，1962年停辦。
1979年6月，經中央軍委批準恢復軍醫進修學院。
1986年9月批準正式列入全軍院校編制序號。
2004年全軍整編將三〇四醫院更名為三〇四臨床部，對外稱解放軍總醫院附屬醫院，列入解放軍總醫院編制序列。
2009年2月，解放軍總醫院與海南省正式簽訂共同建設海南分院戰略合作協議，拉開了總醫院歷史上跨地域、整建制異地辦院的序幕；
2009年8月，海南分院在三亞海棠灣破土動工；
2009年8月，解放軍總醫院第二附屬醫院（原309醫院）完成轉隸移交，隸屬總參謀部領導，更稱呼為解放軍總參謀部總醫院。
2011年12月，38.3萬平方米的現代醫療城竣工并投入試運行；
2012年6月9日，解放軍總醫院海南分院正式開診運行。
中心主任簡介：
王福生，男，中國科學院院士、主任醫師。國家感染性疾病臨床醫學研究中心主任，解放軍總醫院第五醫學中心感染病診療與研究中心主任，全軍傳染病研究所所長。國家杰出青年基金獲得者、國家973（肝病）項目首席科學家、國家自然科學基金創新研究群體牽頭人。
學術專長：
擅長病毒性肝炎、艾滋病和疑難危重肝病的臨床診治工作，并結合臨床難題開展研究。
主要研究方向與課題：
系統地揭示了乙型肝炎臨床免疫學特征及肝臟損傷機制；提出了優化慢性乙肝抗病毒與免疫應答恢復的“爬坡假說”；闡明了艾滋病免疫重建失敗的關鍵機制；開拓了疑難肝病和艾滋病細胞與研究的新方向。
