醫院擁有5位中國工程院院士，1百多名技術三級以上專家，1千多名高職專業技術人員。醫院先后獲得省部級以上科技成果獎勵1300余項，其中，國家科技進步一等獎7項，二等獎20項，國家發明獎2項，軍隊科技進步一等獎21項。 [2]
2017年11月11日下午，復旦大學醫院管理研究所正式發布了《2016年度中國醫院排行榜》和《2016年度中國醫院專科聲譽排行榜》，中國人民解放軍總醫院名列第三。
先后牽頭并主持承擔了國家重大課題330多項。獲國家發明專利50余項。獲得新藥證書7項、診斷試劑生產批件13項、軍隊制劑批件43項。發表病毒性肝炎相關SCI論文800篇（IF≥10論文24篇）。依靠協同創新網絡推廣普及病毒性肝炎相關知識。一方面緊密瞄準解決臨床問題“接地氣”的宏偉目標，組織開展國際化、高質量的多中心臨床研究，取得具有重大臨床指導意義的創新性成果，另一方面創新國際交流與合作模式，與世界大學、研究院所、醫療機構和跨國企業等建立戰略合作伙伴關系，獲得具有“高大上”特性的科研成果，提高學術水平和地位。
學術專長：
擅長病毒性肝炎、艾滋病和疑難危重肝病的臨床診治工作，并結合臨床難題開展研究。
主要研究方向與課題：
系統地揭示了乙型肝炎臨床免疫學特征及肝臟損傷機制；提出了優化慢性乙肝抗病毒與免疫應答恢復的“爬坡假說”；闡明了艾滋病免疫重建失敗的關鍵機制；開拓了疑難肝病和艾滋病細胞與研究的新方向。
國家耳鼻咽喉疾病臨床醫學研究中心是為加強我國耳鼻咽喉疾病醫學科技創新體系建設、打造臨床醫學和轉化研究的“高地”而創建的項目，目標是形成我國耳鼻咽喉疾病重大臨床醫學研究的“國家隊”。
擬通過開展高質量循證醫學研究、驗證新技術和新方法、實施多學科交叉轉化研究、開發和推廣基層適宜技術、探索臨床研究方法和管理模式，搭建國家耳鼻咽喉疾病臨床研究公共技術支撐的平臺。通過高質量臨床多中心研究，出指南、出理論、出技術、出產品、出成效，為國家制定政策提供依據，以提高耳鼻咽喉疾病防控能力，改善民眾健康。
