水母型的體壁結(jié)構(gòu)與水螅型基本相似，也是由兩層上皮肌肉細(xì)胞中間夾有中膠層構(gòu)成，但水母型的中膠層遠(yuǎn)較水螅型發(fā)達(dá)。體壁圍繞的胃循環(huán)腔也較發(fā)達(dá)，它或是一個(gè)簡單的囊，或是被膜分隔成4個(gè)胃囊，由胃囊向傘緣伸出4條（水螅綱水母）或更多的（缽水母）輻射管，并與傘緣平行的環(huán)管相連，由環(huán)管也可伸出離心的小管進(jìn)入觸手，直達(dá)觸手末端。在傘緣或觸手基部有感覺器官，例如眼點(diǎn)或平衡囊。
大多數(shù)水母的輻管、觸手及感官均呈四輻射對稱。觸手是刺胞動物重要的結(jié)構(gòu)之一，雖然某些水螅型與水母型完全缺乏觸手。觸手基本上可分為兩種形態(tài)，一種是頭狀的，短小，刺細(xì)胞集中在觸手端部，組成帽狀結(jié)構(gòu)，一種是絲狀的，細(xì)長，刺細(xì)胞沿觸手全長呈環(huán)狀或瘤狀分布，這兩種觸手或單獨(dú)存在于不同的種，或同時(shí)存在。觸手的數(shù)目、結(jié)構(gòu)、排列方式在不同的種不同，觸手或由于胃腔的伸入而中空，或由胃腔細(xì)胞充滿而呈實(shí)心結(jié)構(gòu)。觸手的數(shù)目也常隨動物年齡的增加而增加，觸手的基部也常膨大，是感覺細(xì)胞或刺細(xì)胞集中的結(jié)果。
身體也區(qū)分成上傘面及下傘面，無緣膜、傘緣具有一圈觸手，不同的種觸手的數(shù)目不同，觸手或?qū)嵭幕蚩招模蜷L或短，也有少數(shù)種沒有觸手，例如根口水母類。傘緣具有感覺器官，也稱為觸手囊，數(shù)目為4或4的倍數(shù)，海月水母有8個(gè)，呈缺刻狀，因此將傘緣分成了8片。下傘中央的垂唇末端向外延伸，形成4個(gè)或8個(gè)口腕，口腕向中心的一側(cè)有溝。
缽水母類的神經(jīng)結(jié)構(gòu)也是由外胚層形成的神經(jīng)網(wǎng)，也具有突觸傳導(dǎo)。原始的種類例如立方水母類（Cubomedusae），也像水螅水母一樣，在傘緣具有兩個(gè)神經(jīng)環(huán)。但多數(shù)的缽水母類已不存在這種傘緣神經(jīng)環(huán)，而是神經(jīng)細(xì)胞集中，形成4個(gè)或8個(gè)神經(jīng)節(jié)分布在傘緣的觸手囊中。顯然，其中含有起博點(diǎn)神經(jīng)元，因?yàn)槿绻腥ト康纳窠?jīng)節(jié)，水母則失去博動的能力，如果切去部分神經(jīng)節(jié)，甚至只留一個(gè)神經(jīng)節(jié)，水母仍能做有節(jié)奏的收縮運(yùn)動。所以神經(jīng)節(jié)中含有起博點(diǎn)神經(jīng)元，它控制著水母類的肌肉收縮運(yùn)動。