水母身體的主要成分是水，并由內外兩胚層所組成，兩層間有一個很厚的中膠層，不但透明，而且有漂浮作用。它們在運動時，利用體內噴水反射前進，遠遠望去，就像一頂頂圓傘在水中迅速漂游；有些水母的傘狀體還帶有各色花紋，在藍色的海洋里，這些游動著的色彩各異的水母顯得十分美麗。
水母型的體壁結構與水螅型基本相似，也是由兩層上皮肌肉細胞中間夾有中膠層構成，但水母型的中膠層遠較水螅型發達。體壁圍繞的胃循環腔也較發達，它或是一個簡單的囊，或是被膜分隔成4個胃囊，由胃囊向傘緣伸出4條（水螅綱水母）或更多的（缽水母）輻射管，并與傘緣平行的環管相連，由環管也可伸出離心的小管進入觸手，直達觸手末端。在傘緣或觸手基部有感覺器官，例如眼點或平衡囊。
生活史的主要階段是單體、水母型，其水螅型階段不發達、或完全消失。缽水母綱的水母體不同于水螅綱的水母體，這種區別主要表現在：缽水母綱的水母體一般體型較大，沒有緣膜；胃循環腔復雜，輻射管發達，有內胚層起源的胃絲，胃絲上有刺細胞；中膠層中有外胚層起源的細胞及纖維；生殖細胞起源于內胚層，水螅綱水母均來源于外胚層；神經感官較發達，集中形成4-8個感覺器官。
在觸手囊上還有外胚層形成的小眼，原始的小眼僅是表皮細胞內陷形成的一個小窩，其中分布有色素及感覺細胞，復雜的小眼有網膜狀的感覺細胞及晶體，如立方水母類，對光線表現出正趨性。此外，在觸手囊上、下傘面有一個表皮內陷形成的外，內感覺窩（sensorypit），是其化學感受器。缽水母類的觸手囊具有敏銳的感覺能力，例如它能感受到比聲波還微弱得多的次聲波。有時風平浪靜的海面會見到水母類的聚集或成群游動，有經驗的漁民及海員會意識到幾小時之后，海面將會有風暴的來臨，這是由于空氣中的氣流及海浪的磨擦所產生的一種人不能查覺的次聲波，而水母類能感受，并提前開始了迎戰風暴的準備。因此人們把某些缽水母類看做是一種有效地預測風暴的指示生物了。仿生學家也利用了它的觸手囊結構，成功的制成了風暴預測器，能提前十幾個小時成功的預報風暴的來臨、方向、級別等。