節省投資
水源熱泵設備占地面積小，省去了鍋爐房以及之配套的煤場、渣場和設備空間節約了土地資源。若與供暖大網掛網，還要增加一筆費用：設計費、施工費、掛網配套費等每年還要交采暖費。原鍋爐循環系統、末端地熱和暖氣片均可利用，可節省初投資。
水源熱泵運行穩定可靠。
水體的溫度一年四季相對穩定，特別是地下水，其波動的范圍遠遠小于空氣的變動，是很好的熱泵的冷熱源。因此，使得熱泵機組運行可靠、穩定，也不存在空氣源熱泵的冬季除霜等難點問題。
水源熱泵環境效益顯著。
水源熱泵機組的運行沒有任何污染，可以建造在居民內，沒有燃燒，沒有排煙，也沒有廢棄物，不需要堆放燃料廢物的場地，且不用遠距離輸送熱量。
一機多用，應用范圍廣。
水源熱泵系統可供暖、供冷，還可供生活熱水，一機多用，一套系統可以替代鍋爐和空調兩套裝置。特別是對于同時有供暖和供冷要求的建筑物，水源熱泵有明顯的優點。不僅節省了大量能源，而且減少了設備的初投資。
水層的地理結構問題。
對于從地下取水回灌的使用，必須考慮到所用的地質結構，確保可以在經濟合理的條件下打井找到合適的水源，同時還應保持用水回灌得以實現。
水源熱泵投資的經濟性。
水源熱泵的運行效率較高、費用較低，但與傳統的供熱供冷方式相比，在不同的需求的條件下，其投資經濟性會有所不同。據有關資料介紹通過對水源熱泵冷熱水機組、空氣源熱泵、溴化鋰直燃機、水冷冷水機組加燃油鍋爐四種方案進行經濟比較，水源熱泵冷熱水機組初投資小。
