結構設計
為了保證氣流幾乎不受干擾，就必須進行結構設計，必要的謹慎可以防止房間里任何地方的灰塵積累。
設計方案
要確定設計方案，必須先對房間的工作性質以及其中的氣流條件進行認真的考慮。發塵量大的車間不宜采用地面送風形式，潔凈度要求高的車間應盡可能遠離其它車間。
材料選擇
作為潔凈室頂棚，墻面和地板的材料必須是不宜破裂、不易沾顆粒，以及幾乎不起塵的材料，另外根據房間不同的工作條件，還必須考慮材料的化學性能是否穩定。
壓力和氣流
為了保證房間的潔凈度，必須防止外面污染氣流進入室內，要達到這個目的，房間里必須保持正壓。為了獲得所要求的房間壓力，必須補充適當的新鮮空氣。
實驗室潔凈等級分類
實驗室凈化專家表示，從控制微生物的角度出發性，符合實驗室凈化要求的生物學實驗室，可以分為以下4個等級：????
1、一級潔凈度無要求，最小換氣次數無要求，可開窗，與相鄰相通室外房間最小負壓差無要求，溫度為18~28℃，相對濕度≤78%，噪音≤60dB，照度200?
2、二級潔凈度無要求，最小換氣次數無要求，可開窗，與相鄰相通室外房間最小負壓差無要求，溫度為18~27℃，相對濕度30~60%，噪音≤60dB，照度300
3、三級潔凈度7或8，最小換氣次數15或12，與相鄰相通室外房間最小負壓差-10，溫度為18~25℃，相對濕度30~60%，噪音≤60dB，照度350?????
4、四級潔凈度7或8，最小換氣次數15或12，與相鄰相通室外房間最小負壓差-10，溫度為18~24℃，相對濕度30~60%，噪音≤60dB，照度350
工程設計不合理
這種現象比較少見，主要是在一些小型的凈化級別要求不太高的潔凈室建造上。現在凈化的競爭比較激烈，一些施工單位為了獲得工程，在投標中給出了較低的報價。在后期施工中，利用一些單位不太懂行的情況，偷工減料，使用功率較低的空調通風壓縮機組，使送風功率與凈化面積不匹配，導致潔凈度不合格。
合理的氣流組合
潔凈實驗室內的主要工作區處于潔凈空氣的上游方向，使得工作區域保持潔凈狀態。潔凈室氣流有層流（單向流）和亂流（非單向流）兩個基本形式。層流潔凈室自凈能力強，渦流少，易保持潔凈度；亂流潔凈室渦流多，粒子在室內停留時間長，不適合高潔凈度實驗室。
