此外，有一種低壓冷藏集裝箱與氣調冷藏集裝箱類似，這種集裝箱是將果蔬置于低壓環境中進行儲運。箱內壓力為1333～10666 Pa，相對濕度90%～95%，溫度一2℃～+16℃。氧的含量為（0.1±0.03）%，要進行換氣，以便限制乙烯和 等有害氣體。低壓冷藏集裝箱由制冷系統、真空系統和動力系統組成。制冷系統用于降低溫度；真空系統用于排除箱中的空氣和水汽；動力系統用于柴油發電，供集裝箱用電。
隔熱集裝箱在20世紀70年代前曾經是國際上冷藏保鮮貨物的主要運輸工具之一，隨著20世紀80年代之后機械式冷藏集裝箱的大量使用，隔熱集裝箱已逐步被更為靈活的機械式冷藏集裝箱所取代，但在某些具有穩定貨源的航線上仍有使用。
機械式冷藏集裝箱也有一些缺點：如設備復雜、初始投資大、維修費用高；箱內溫度梯度要大于液氮冷藏集裝箱；箱內需設風機、風道系統，會增加箱內貨物的干耗、脫水。
⒈冷藏箱裝貨后應檢查冷藏或冷凍貨的原有質量，并在貨單上加以說明。
⒉在裝箱過程中，應嚴格裝貨堆碼原則，避免冷風短路造成降溫不平衡，降低制冷裝置的制冷效率。
⒊冷凍貨長距離運輸時，箱內設定溫度與設定溫度差不能超過3℃。若運送冷卻貨，其溫度誤差應不大于0.5℃，不大于0.25℃。
⒋集裝箱運送新鮮水果、蔬菜等，應及時打開新風口，進行通風換氣。但運送冷凍貨時，應關閉新風口。
⒌在運送紙盒包裝的冷卻貨時，應根據室外氣溫及濕度情況，及時進行通風，保持箱內空氣的干燥，防止包裝箱外表面凝露。