在噴泉得到廣泛應用的過程中，也出現了一些問題和不足，有些認識上的誤區和不良傾向應該引起人們的重視。否則將對噴泉設計行業的健康發展產生負面影響。
1.方案設計上的盲目性，往往導致作品成為敗筆，使作品難于長久存在。
2.細部設計的不合理直接影響作品效果。
3.質次價高的偽劣產品直接影響著有關廠商和公司的信譽。
4.節能、節水、環保問題應引起足夠的重視。
好的噴泉方案設計需要噴泉專業的設計人員充分聽取和吸納噴泉所在地的規劃師、建筑師、園藝師及建設單位等相關人士的建議和意見，因時、因地的拿出合理的方案設計，噴泉的水池和噴水造型應該與周邊的環境、空間、建筑、綠化形成協調的關系，適于安靜、幽雅的氛圍就不宜搞成熱烈、活躍的效果。以激光彩色音樂噴泉為例，國外一般多設在旅游景點的公園或游樂場和文化公園里，設有觀賞的座位，使人們可以駐足休閑欣賞噴泉。而我們有的城市則設在空間狹小、交通流量大，而且不具備停車條件的道路旁或交通環島中心，很顯然這種選擇是不科學、不合理的。噴泉很容易造成交通堵塞。
噴泉是耗能的景觀工程，有些超高水柱或大型激光彩色音控噴泉其動力及燈光耗能上千或數千瓦，也就是說，噴泉只要開兩個小時，就要耗數千度電，對于噴泉項目投資和日后的維持運行都是很大的費用，需要進行認真論證、評估。在保障噴泉設計效果的前提下，盡可能地節約能源，這在噴泉方案設計階段時就應該進行量體裁衣的設計。
構圖：音樂是聽覺的藝術，音樂噴泉則是聽覺視覺共存的藝術，把音樂純粹的聽覺上的時間上的情緒變化轉化為視覺上空間上的變化，在時間上以點、線、面、體的水型組合以及燈光色彩的變化，營造音樂的情緒或意境。如果說節奏是音樂噴泉的時間因素，那么噴泉的水型、色彩以及運動形態就是音樂噴泉的空間因素，這里稱之為噴泉的構圖。