隔離變壓器的原理和普通變壓器的原理是一樣的。都是利用電磁感應原理。隔離變壓器一般（但并非全部）是指1：1的變壓器。由于次級不和大地相連，次級任一根線與大地之間沒有電位差，但使用。常用作維修電源。
一般變壓器原、副繞組之間雖也有隔離電路的作用，但在頻率較高的情況下，兩繞組之間的電容仍會使兩側電路之間出現靜電干擾。為避免這種干擾，隔離變壓器的原、副繞組一般分置于不同的心柱上，以減小兩者之間的電容；也有采用原、副繞組同心放置的，但在繞組之間加置靜電屏蔽，以獲得高的抗干擾性。
雙重屏蔽隔離變壓器當一次側同時出現共模和差模干擾時，將一層屏蔽層連接到一次側以降低差模噪聲，將另一層屏蔽層連接到共模干擾的基準面或地線上以降低共模噪聲。隔離變壓器外殼也被連接到地線上。屏蔽層的連接線必須短而可靠，否則在高頻時，屏蔽效果明顯降低。
三重屏蔽的隔離變壓器當需要更高隔離要求的時候，可選用三重屏蔽的隔離變壓器。三種不同屏蔽層的連接方法取決于變壓器的安裝方法以及接地條件。一般將變壓器安裝在設備機架的隔板或屏蔽室的隔墻上，并將機架接設備地線，輸入電源地被斷開加絕緣管保護。